『amiibo』１体に、読み書き対応ソフトのデータは1つ分しか書き込めません。

http://www.nintendo.co.jp/amiibo/list/index.html

『amiibo』１体に、読み書き対応ソフトのデータは1つ分しか書き込めません。
他の読み書き対応ソフトのデータを書き込む場合は、Wii U本体設定の『amiibo設定』でデータを消去してください。

読み書き対応ソフトのデータが書き込まれているamiiboは、他の読み込み専用ソフトでもご使用いただけます。
【例】
『大乱闘スマッシュブラザーズ for Wii U』のデータが書き込まれた「マリオ」のamiiboでも、『マリオカート８』で読み込めば、「マリオ」のレーシングスーツが使えるようになります。